MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes 07PF0776 chromosome

Total Repeats: 66241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017728	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017728	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017728	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017728	A	6	6	301	306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017728	G	7	7	307	313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017728	CAAT	2	8	322	329	50 %	25 %	0 %	25 %	386730762
7	NC_017728	A	9	9	363	371	100 %	0 %	0 %	0 %	386730762
8	NC_017728	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730762
9	NC_017728	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730762
10	NC_017728	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730762
11	NC_017728	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
12	NC_017728	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
13	NC_017728	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730762
14	NC_017728	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730762
15	NC_017728	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730762
16	NC_017728	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730762
17	NC_017728	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730762
18	NC_017728	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
19	NC_017728	CTTA	2	8	945	952	25 %	50 %	0 %	25 %	386730762
20	NC_017728	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730762
21	NC_017728	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
22	NC_017728	AC	3	6	1016	1021	50 %	0 %	0 %	50 %	386730762
23	NC_017728	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730762
24	NC_017728	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730762
25	NC_017728	GACC	2	8	1057	1064	25 %	0 %	25 %	50 %	386730762
26	NC_017728	GAAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	25 %	0 %	386730762
27	NC_017728	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730762
28	NC_017728	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	386730762
29	NC_017728	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730762
30	NC_017728	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730762
31	NC_017728	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730762
32	NC_017728	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730762
33	NC_017728	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730762
34	NC_017728	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
35	NC_017728	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730762
36	NC_017728	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	386730762
37	NC_017728	AG	3	6	1498	1503	50 %	0 %	50 %	0 %	386730762
38	NC_017728	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730762
39	NC_017728	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730762
40	NC_017728	A	6	6	1580	1585	100 %	0 %	0 %	0 %	386730762
41	NC_017728	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730762
42	NC_017728	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	386730762
43	NC_017728	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017728	T	6	6	1805	1810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017728	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017728	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017728	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730763
48	NC_017728	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
49	NC_017728	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
50	NC_017728	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730763
51	NC_017728	TCAA	2	8	2098	2105	50 %	25 %	0 %	25 %	386730763
52	NC_017728	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730763
53	NC_017728	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730763
54	NC_017728	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	386730763
55	NC_017728	TACT	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	386730763
56	NC_017728	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
57	NC_017728	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730763
58	NC_017728	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	386730763
59	NC_017728	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
60	NC_017728	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730763
61	NC_017728	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	386730763
62	NC_017728	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730763
63	NC_017728	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730763
64	NC_017728	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730763
65	NC_017728	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730763
66	NC_017728	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
67	NC_017728	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730763
68	NC_017728	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017728	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
70	NC_017728	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730764
71	NC_017728	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	386730764
72	NC_017728	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
73	NC_017728	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730764
74	NC_017728	GCTG	2	8	3261	3268	0 %	25 %	50 %	25 %	386730764
75	NC_017728	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	386730764
76	NC_017728	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730764
77	NC_017728	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
78	NC_017728	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730764
79	NC_017728	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	386730764
80	NC_017728	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730764
81	NC_017728	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
82	NC_017728	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730764
83	NC_017728	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	386730764
84	NC_017728	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	386730764
85	NC_017728	TA	3	6	3671	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	386730764
86	NC_017728	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730764
87	NC_017728	TTCT	2	8	3713	3720	0 %	75 %	0 %	25 %	386730764
88	NC_017728	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730764
89	NC_017728	GC	3	6	3786	3791	0 %	0 %	50 %	50 %	386730764
90	NC_017728	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730764
91	NC_017728	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730764
92	NC_017728	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730764
93	NC_017728	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730764
94	NC_017728	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730764
95	NC_017728	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
96	NC_017728	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730764
97	NC_017728	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730764
98	NC_017728	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730764
99	NC_017728	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	386730764
100	NC_017728	GTA	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730764
101	NC_017728	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730764
102	NC_017728	AGTT	2	8	4301	4308	25 %	50 %	25 %	0 %	386730764
103	NC_017728	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730764
104	NC_017728	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	386730764
105	NC_017728	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730764
106	NC_017728	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017728	T	8	8	4504	4511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017728	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017728	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
110	NC_017728	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017728	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017728	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017728	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017728	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	386730765
115	NC_017728	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730765
116	NC_017728	CCG	2	6	4784	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730765
117	NC_017728	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	386730766
118	NC_017728	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386730766
119	NC_017728	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730766
120	NC_017728	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730766
121	NC_017728	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730766
122	NC_017728	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	386730766
123	NC_017728	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730766
124	NC_017728	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	386730766
125	NC_017728	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730766
126	NC_017728	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730766
127	NC_017728	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	386730766
128	NC_017728	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	386730766
129	NC_017728	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730766
130	NC_017728	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730766
131	NC_017728	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730766
132	NC_017728	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730766
133	NC_017728	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730766
134	NC_017728	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730766
135	NC_017728	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730766
136	NC_017728	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730766
137	NC_017728	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	386730766
138	NC_017728	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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